生物信息学创新实践社区(openbiox)

前段时间加入了Openbiox组织,其是由社区驱动建立的生物信息学创新协作社区;个人觉得这个是国内首个具有开源创新精神的生物信息社区,其中有不少比较有意思的项目以及学习任务可供大家选择参与,拓展技能以及实践操作

因此向大家推荐一下,欢迎加入

发起 openbiox 计划的想法主要萌芽于谷歌的Google Summer of Code(GSoC)项目。另外,不出意外的话,国家后续会进一步加大生物信息学(特别是医学健康数据管理、挖掘和转化)方向上的投入,相关方向非常值得我们去发展和钻研。

openbiox 目标

  • 普及开源科学精神
  • 营造生信开源社区
  • 培育生信优秀人才
  • 孵化生信创新项目

交流方式:

与团队活动、工作相关的线上交流和重要信息通知在“钉钉”平台公布,记录留存归档,以备查阅。与生活相关的信息则在“微信群”中发布。

所有生物信息学开源项目的协作均基于开源代码托管网站GitHub-openbiox开展。其他线上即时交流方式由实践组内部讨论决定,对于部分重要的交流或者事件信息以截图形式分享或保存,以备后期宣传使用。

还有每周一问环节,组员可将自己在平时生活学习工作中的疑难问题提交至openbiox,供大家交流学习,比如往期的问题整理链接:openbiox 的每周一问(长期更新)

定期还有主题学习周活动,比如:

  • Linux 系统和 Shell 编程
  • 学习编程语言的包/模块的开发
  • Web service 开发基础
  • 个人博客、静态软件主页和文档服务的构建

不定期有新的协作项目发布,比如:Bioconductor Workflow 翻译项目限时报名

第一批已完成发布的项目有:Cookbook for R 中文版

如果想了解我们已经做了什么,可看生物信息学创新实践社区 openbiox 需要你以及Github仓库

加入方式可看上述官方主页/知乎主页/Github,发送邮件申请

欢迎大家一起加入openbiox社区,共同参与生物信息开源项目

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